A Confederação Brasileira de Futebol (CBF), através da Diretoria de Competições, divulgou o sistema de disputa do Campeonato Brasileiro das Séries C e D em 2009. A Série C será composta por 20 clubes, divididos em dois grupos de dez, observadas as distâncias regionais. Luverdense e Mixto representarão Mato Grosso e devem ficar no mesmo grupo.
Os quatro primeiros colocados da competição garantem acesso para a Série B em 2010. Descem para a Série D os dois últimos classificados de cada grupo da primeira fase, em um total de quatro clubes.Os grupos e data de início ainda não foram definidos. As partidas serão disputadas em ida e volta, jogando todos contra todos dentro do grupo. Classificam-se oito clubes (quatro de cada grupo) para a segunda fase, que passam a jogar em ida e volta, no sistema eliminatório (mata-mata) até a decisão do título.
Além dos dois clubes mato-grossenses, outros dez que vão participar da terceirona do ano que vem já são conhecidos: Paysandu (PA), ASA (AL), Salgueiro (PE), Guaratinguetá (SP), Ituiutaba (MG), Marcílio Dias (SC), Caxias (RS), América (MG), Icasa (CE) e Sampaio Correia (MA). Os outros oito serão definidos assim: os quatro que estão no octogonal da Série C desse ano e não conseguirem vaga na Série B, mais os quatro rebaixados da Série B desse ano.
A Série D terá a participação de 40 clubes, com quatro clubes ascendendo à Série C em 2010. O campeão da Copa Mato Grosso desse ano, Araguaia, será o representante do Estado na competição. O certame será dividido em oito grupos de cinco, com os clubes se enfrentando dentro dos grupos em partidas de ida e volta, todos contra todos. Classificam-se dois clubes de cada grupo para a segunda fase, em um total de 16.
Os 16 classificados jogam em ida e volta, no sistema de mata-mata, classificando-se, sucessivamente, os vencedores até a decisão do título. Terão acesso à Série C 2010 os quatro clubes que obtiverem classificação para a quarta fase (semifinais).