O número de alunos na rede superior de ensino têm crescido muito nos últimos anos em Alta Floresta. A prefeitura não tem dados oficiais, mas calcula-se que o número tenha dobrado nos últimos dois anos, visto que novas faculdades foram implantadas.
Atualmente, o município conta com 3 instituições de ensino regulares Unemat, Unic e Uniflor e ainda com outras duas que oferecem educação à distância, Unipar e Educom. Mais de mil acadêmicos são atendidos.
Treze cursos são oferecidos: Biologia, engenharia florestal, agronomia, matemática, história, pedagogia, letras, administração, ciências contábeis, turismo, análise de sistema, matemática e assistência social. A implantação de novos cursos, que venham a atender o potencial econômico da região, sempre carente de mão-de-obra especializada, tem sido cobrada pela comunidade.
